Trước đây, địa bàn xã Phong Dụ Hạ là một phần của xã Phong Dụ cũ.

Trước năm 1964, Phong Dụ là một xã thuộc huyện Văn Bàn.

Ngày 16 tháng 12 năm 1964, Chính phủ ban hành Quyết định số 177-CP[4] về việc thành lập huyện Văn Yên trên cơ sở điều chỉnh xã Phong Dụ thuộc huyện Văn Bàn (nay thuộc tỉnh Lào Cai) về huyện Văn Yên quản lý.

Ngày 17 tháng 2 năm 1965, Bộ Nội vụ ra Quyết định số 44-NV[5] về việc chia xã Phong Dụ thành 3 xã: Phong Dụ Thượng, Phong Dụ Hạ và Xuân Tầm.